SectoresFisioterapia, dental, psicología y consultas privadas

Facturación para clínicas y consultas con la exención sanitaria bien aplicada

Agenda de citas, facturas exentas de IVA cuando corresponde (art. 20 LIVA), bonos de sesiones y planes de tratamiento con cobro recurrente. Conforme a VeriFactu sin que la consulta cambie su rutina.

Conforme RD 1007/2023 (VeriFactu) · Datos en la UE · Sin permanencia

Una clínica o consulta privada — fisioterapia, dental, psicología, podología, medicina estética — necesita un software de facturación que entienda la particularidad fiscal del sector: la asistencia sanitaria prestada por profesionales titulados está exenta de IVA (art. 20.Uno.3º LIVA), pero no todo lo que pasa en la clínica lo está. La fisioterapia por prescripción es exenta; el masaje deportivo de bienestar, no. El tratamiento dental, exento; el blanqueamiento estético, al 21 %. Cofactu permite marcar la exención por línea de factura, de modo que una misma visita con conceptos mixtos sale fiscalmente correcta.

VeriFactu también alcanza a las consultas: desde enero de 2027 (sociedades) y julio de 2027 (autónomos), cada factura — también la de una sesión de 50 € — debe generarse con registro firmado, hash encadenado y QR verificable. Las facturas en Word o en el programa de gestión clínica sin certificación dejan de valer.

El día a día de la consulta está cubierto: agenda de citas por profesional con paso directo a cobro y factura, bonos de sesiones (10 fisioterapias, 8 de psicoterapia) con saldo controlado, y planes de tratamiento largos (ortodoncia, tratamientos capilares) cobrados por cuotas recurrentes con aviso si una cuota falla.

El problema

Lo que complica facturar en clínicas y consultas

¿Exento o al 21 %? Depende — y equivocarse cuesta

La exención sanitaria no va por sector sino por acto: diagnóstico, prevención y tratamiento por profesional titulado, exento; finalidad estética o de bienestar, al 21 %. Facturar todo exento "porque somos clínica" es una contingencia fiscal que aflora en la primera comprobación.

El software clínico no factura conforme

Muchos programas de gestión clínica hacen historiales estupendos y facturas que no cumplen el RD 1007/2023: sin registro firmado, sin cadena de hashes, sin QR. Desde 2027, eso son sanciones de hasta 50.000 € al año — y rehacer la facturación a mitad de ejercicio.

Bonos de sesiones sin control de saldo

El bono de 10 sesiones cobrado en enero es un anticipo que se va consumiendo: si el control es una hoja de papel en la recepción, no sabes cuántas sesiones debes ni cuánto dinero anticipado tienes comprometido contablemente.

Tratamientos largos = perseguir pagos

La ortodoncia de 18 meses o el tratamiento capilar de 12 cuotas significan perseguir transferencias mes a mes. Cada cuota que se retrasa es una llamada incómoda que nadie en la recepción quiere hacer.

La solución

Qué resuelve Cofactu para clínicas y consultas

Funcionalidad real, en producto hoy — no roadmap. Todo incluido en el plan, sin módulos de pago aparte.

Exención sanitaria por línea de factura

Marca cada concepto como exento (art. 20 LIVA) o sujeto al 21 % en la misma factura. El desglose viaja correcto al registro VeriFactu y al modelo 303 — solo computa el IVA de lo realmente sujeto.

Agenda de citas por profesional

Citas con servicio, profesional y estado, conectadas al cobro: al completar la visita, el servicio pasa a la factura o ticket sin reteclear. Las ausencias y cancelaciones quedan registradas en la ficha del paciente.

Bonos de sesiones con saldo vivo

El bono de 10 sesiones se vende como anticipo, cada visita descuenta una sesión y el saldo pendiente es visible en la ficha — para la recepción y para la contabilidad. Sin papel, sin sesiones de propina por descontrol.

Cuotas recurrentes para tratamientos largos

Ortodoncia en 18 cuotas, plan capilar en 12: el cobro se programa de forma recurrente, cada cuota genera su factura conforme y el sistema avisa si un cobro falla — la recepción deja de perseguir transferencias.

Factura completa al paciente en dos toques

El paciente que necesita la factura con su NIF (para deducción autonómica del IRPF o para su seguro) la recibe por email al momento, generada desde el mismo cobro. También factura a aseguradoras y mutuas como clientes empresa.

Tu gestor, dentro

Acceso de solo lectura o gestión para tu asesoría: facturas, gastos y libro de IVA (con exentas correctamente separadas) en tiempo real, y presentación de modelos AEAT desde la propia plataforma.

Más detalle
Cómo funciona

Una semana de consulta en Cofactu

De la agenda al cierre fiscal del trimestre, con la exención bien aplicada en cada acto.

  1. 1

    Las citas llenan la agenda

    Lunes: 12 citas entre los dos fisios de la clínica, cada una con su servicio. La vista por profesional muestra huecos y solapamientos de un vistazo.

  2. 2

    Visita completada, cobro inmediato

    La sesión de fisioterapia por prescripción se cobra al salir: 45 € exentos de IVA, ticket VeriFactu con QR. La paciente del bono descuenta su sesión 6 de 10 — el saldo se actualiza solo.

  3. 3

    Conceptos mixtos, factura correcta

    El paciente de medicina estética se lleva tratamiento (21 %) y revisión médica (exenta) en la misma factura: cada línea con su tratamiento fiscal, el desglose correcto en el registro VeriFactu.

  4. 4

    El trimestre cuadra solo

    El 303 computa solo el IVA de las operaciones sujetas; las exentas van a su casilla. Tu gestor lo revisa en la plataforma y lo presenta desde ahí. Nadie reconstruye nada en Excel.

Ejemplo real

Factura de clínica con conceptos exentos y sujetos a IVA

Así queda la fiscalidad de una operación típica del sector en Cofactu. Cada registro lleva hash SHA-256 encadenado, firma digital y QR de verificación AEAT.

Concepto Importe
Sesión fisioterapia (tratamiento por prescripción) — exenta art. 20.Uno.3º LIVA 45,00 €
Masaje deportivo de mantenimiento (no asistencia sanitaria) 35,00 €
Crema de recuperación muscular 12,40 €
Base exenta de IVA 45,00 €
Base sujeta al 21 % 47,40 €
IVA 21 % 9,95 €
Total factura 102,35 €
FAQ

Preguntas frecuentes

Mi actividad está exenta de IVA, ¿me afecta igualmente VeriFactu?
Sí. VeriFactu regula cómo se emiten las facturas, no qué IVA llevan: aunque todas tus operaciones estén exentas, cada factura debe generarse con registro firmado, hash encadenado y QR desde julio de 2027 (autónomos) o enero de 2027 (sociedades). La exención de IVA no exime del RD 1007/2023.
¿Cómo sé qué servicios de mi clínica van exentos y cuáles al 21 %?
El criterio general: actos de diagnóstico, prevención y tratamiento realizados por profesional sanitario titulado, exentos (art. 20.Uno.3º LIVA); actos con finalidad estética o de bienestar sin prescripción, al 21 %. La frontera tiene casuística (la DGT se ha pronunciado sobre fisioterapia deportiva, psicología, medicina estética…), así que configura tu catálogo de servicios con tu asesor — en Cofactu cada servicio guarda su tratamiento fiscal y se aplica solo al facturar.
¿Puedo facturar a aseguradoras y mutuas?
Sí. La aseguradora se da de alta como cliente con su NIF y recibe facturas completas — individuales o agrupando las sesiones del mes. Los pacientes de mutua y los privados conviven en la misma agenda y la misma numeración VeriFactu.
¿El paciente puede pedir factura para la deducción de su comunidad autónoma?
Sí, y es habitual: varias comunidades deducen gastos sanitarios en el tramo autonómico del IRPF. Desde el mismo cobro se emite la factura completa con el NIF del paciente y le llega por email con su QR verificable.
¿Cofactu guarda historiales clínicos?
No — y es deliberado. Cofactu gestiona la parte administrativa y fiscal (citas, cobros, facturas, bonos, cuotas); el historial clínico pertenece a tu software sanitario especializado, con sus requisitos propios de protección de datos de salud. Los datos administrativos viven cifrados en servidores de la UE.
¿Qué pasa si falla el cobro de una cuota de ortodoncia?
El sistema marca la cuota como fallida y te avisa para reintentarla o contactar al paciente, con el estado de cada plan de cuotas visible en su ficha. Las cuotas cobradas generan su factura conforme automáticamente.
Otros sectores

Cofactu también está pensado para

Ver todos los sectores.

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